Με την από 10 Ιουλίου 2009 Κοινή Απόφαση των Υπουργών ΠΕ.ΧΩ.Δ.Ε. – ΠΟΛΙΤΙΣΜΟΥ – ΤΟΥΡΙΣΤΙΚΗΣ ΑΝΑΠΤΥΞΗΣ – ΕΜΠΟΡΙΚΗΣ ΝΑΥΤΙΛΙΑΣ ΑΙΓΑΙΟΥ & ΝΗΣΙΩΤΙΚΗΣ ΠΟΛΙΤΙΚΗΣ, εγκρίθηκε η Τροποποίηση της από 22/06/01 υφιστάμενης Κ.Υ.Α. Έγκρισης Περιβαλλοντικών Όρων για τα έργα του Λιμένα Κέρκυρας.
Την ως άνω Τροποποίηση είχε ζητήσει ο Οργανισμός Λιμένα Κέρκυρας Α.Ε. με το από 9 Νοεμβρίου 2006 έγγραφό του, από την Ειδική Υπηρεσία Περιβάλλοντος (Ε.Υ.ΠΕ.) του Υ.ΠΕ.ΧΩ.Δ.Ε. υποβάλλοντας σχετική Μελέτη, προκειμένου να εντάξει στο Νέο Προγραμματικό Σχέδιο (Master Plan) του Λιμένα Κέρκυρας :
· Τη δημιουργία λιμένα θαλαμηγών και μικρών κρουαζιεροπλοίων,
· Τη δημιουργία χώρου ελλιμενισμού για την εξυπηρέτηση υδροπλάνων,
· Τη δημιουργία νέου σταθμού ανεφοδιασμού καυσίμων με υπόγειες δεξαμενές,
· Την κατασκευή κρηπιδώματος ελλιμενισμού πλωτών χώρων στάθμευσης (Parking).
Για την έγκριση της εν λόγω τροποποίησης μεταξύ άλλων προαπαιτήθηκαν :
Þ Έγκριση της Διυπουργικής Επιτροπής Σχεδιασμού & Ανάπτυξης Λιμένων,
Þ Γνωμοδότηση του Νομαρχιακού Συμβούλιου Κέρκυρας,
Þ Απόφαση Χωροθέτησης του λιμένα θαλαμηγών και μικρών κρουαζιεροπλοίων από το Υπουργείο Τουριστικής Ανάπτυξης,
Þ Απόφαση του Υπουργείου Πολιτισμού για τα νέα έργα που εντάχθηκαν στην εν λόγω Τροποποίηση,
Þ Έγκριση της Διεύθυνσης Λιμενικών Έργων / Γ.Γ.Δ.Ε. του Υ.ΠΕ.ΧΩ.Δ.Ε. κ.ά.
Η έκδοση της εν λόγω Κοινής Υπουργικής Απόφασης έχει ιδιαίτερη βαρύτητα και σημασία για την ανάπτυξη και τον εκσυγχρονισμό του Λιμένα, αφού αποτελεί απαρέγκλιτη προϋπόθεση για τη δημοπράτηση – κατασκευή των νέων έργων που εντάχθηκαν στο Προγραμματικό Σχέδιο (Master Plan) του Λιμένα Κέρκυρας.